ASPP2基因启动子区DNA甲基化及转录因子DNA结合位点的干湿研究

• 作者: 孙倩 王进科
• 来源期刊: 生物医学工程研究
• 学科: 医学
• 关键词: ASPP2 DNA甲基化 转录因子结合位点 生物信息学分析 DNA测序
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 254-258,267
• 分类号: R318
• 字数: 3639字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-6278.2010.04.008

摘要

对p53凋亡刺激蛋白2 (ASPP2)基因启动子区进行了甲基化及转录因子结合位点(TFBS) 的生物信息学分析及实验研究.结果表明,在该基因近端启动子区存在一个长1391bp的CpG岛,且此区域中包含19个转录因子的37个结合位点,其中有13个转录因子的结合位点含有CpG;甲基化预测发现在含CpG的23个TFBS中有18个位点的CpG易发生甲基化.由此推断ASPP2是典型的多因子调控的CpG岛基因,CpG岛的异常甲基化将影响转录因子结合,导致ASPP2基因表达下调.通过对人肝癌细胞株HepG和人成纤维细胞HFL-1的ASPP2基因启动子CpG岛中含4个E2F结合位点区域的甲基化实验检测,证明这种推断是正确的.这一研究说明,对重要基因启动子区DNA甲基化及TFBS的生物信息学研究可为相关的实验研究提供指南,对促进基因表达的表观遗传调控研究具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙倩	东南大学生物电子学国家重点实验室	2	5	2.0	2.0
2	王进科	东南大学生物电子学国家重点实验室	17	133	7.0	11.0