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摘要:
通过同源映射的方法,利用6个模式物种的蛋白质相互作用数据预测水稻的蛋白质相互作用网络.预测到水稻中有4483个蛋白质参与了24942个蛋白质相互作用.通过GO注释,结构域相互作用,基因共表达等3个证据评估预测网络的质量,并对网络进行了拓扑属性分析.结果表明水稻的蛋白质相互作用网络符合scale-free属性.通过对网络中功能模块的分析,可以预测蛋白质的功能和亚细胞定位信息.
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分类
基于结构域理化性质的蛋白质相互作用方向预测
蛋白质
相互作用
结构域
理化特性
支持向量机
方向预测
内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 水稻蛋白质相互作用网络的预测与分析
来源期刊 四川大学学报(自然科学版) 学科 生物学
关键词 水稻 蛋白质相互作用 同源映射 蛋白质功能预测
年,卷(期) 2010,(6) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 1417-1422
页数 分类号 Q811.4
字数 3875字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.0490-6756.2010.06.039
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张义正 四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室 150 2059 26.0 38.0
2 徐加豹 四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室 2 4 1.0 2.0
3 李校 四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室 10 16 2.0 3.0
4 蔡浩洋 四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室 5 25 3.0 5.0
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研究主题发展历程
节点文献
水稻
蛋白质相互作用
同源映射
蛋白质功能预测
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
四川大学学报(自然科学版)
双月刊
0490-6756
51-1595/N
大16开
成都市九眼桥望江路29号
62-127
1955
chi
出版文献量(篇)
5772
总下载数(次)
10
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