羊草LVAP1基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 于莹 冯树丹 吕召志 尹悦佳 徐明华 李蕊沁 韩四平 黎莉
• 来源期刊: 哈尔滨商业大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: LVAP1基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 651-656
• 分类号: Q78
• 字数: 3533字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-0946.2010.06.004

摘要

克隆羊草VHA-c基因并预测其编码蛋白质结构和功能.由羊草总RNA经RACE克隆获得VHA-c基因cDNA,采用生物信息学方法预测蛋白结构和功能.获得羊草VHA-c基因cDNA,命名为LVAP1基因(GenBank 登录号为 GQ397276),LVAP1基因开放阅读框为498 bp,编码165个氨基酸,有4个α-螺旋跨膜结构域,在第4个结构域上含有一个高度保守的Glu142残基,推测它是质子的结合位点.进化树分析显示,羊草LVAP1蛋白与小麦、碱蓬和冰叶日中花等植物的VHA-c蛋白具有高度的同源性,推测LVAP1亚基与其他VHA-c亚基执行相似的功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩四平		7	13	2.0	3.0
2	尹悦佳		13	40	4.0	6.0
3	李蕊沁		3	16	3.0	3.0
4	冯树丹		29	148	7.0	10.0
5	于莹		51	230	9.0	12.0
6	吕召志		3	16	3.0	3.0
7	黎莉		4	98	4.0	4.0
8	徐明华		3	33	3.0	3.0