基于形态特征和线粒体16S rRNA基因序列探讨棱鳀属的系统进化

• 作者: 倪勇 张凤英 张永 沈盎绿 赵云龙 马凌波 马春艳
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 线粒体DNA 16S rRNA 棱鳀属 系统进化
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 471-477
• 分类号: Q959
• 字数: 4278字
• 语种: 中文

摘要

对6种棱鳀属(Thryssa Cuvier 1829)鱼类共21个个体的16S rRNA基因进行PCR扩增,经比对校正得到572bp的基因片段,共检测到8个单倍型,棱鳀属6个种所有单倍型之间共存在8个插入/缺失;此外有99个变异位点,其中简约信息位点87个;多态位点比例为1713%;序列中转换多于颠换,转换/颠换之比为1.6;A+T含量(53.6%)明显高于C+G含量(46.4%),序列表现出明显的T偏倚.基于Kimura参数法,计算的种间遗传距离介于0.4%[黄吻棱鳀(T. vitrirostris)与中颌棱鳀(T. mystax)]到11.33%[黄吻棱鳀与赤鼻棱鳀(T.kammalensis)]之间.以日本鳀(Engraulis japonius)和欧洲鳀(Engraulis encrasicholus)为外群构建的NJ树和ML树中,赤鼻棱鳀位于进化树的基部,是最早分化出来的种;进化树显示,黄吻棱鳀和中颌棱鳀关系最近.本研究结果支持形态学得出的赤鼻棱鳀最先分化的结论,认为中颌棱鳀和黄吻棱鳀可能为同-个种,至于汉氏棱鳀(T.hamiltonii)和杜氏棱鳀(T.dussumieri)的分类地位有待进一步确认.