启动子的潜在语义索引差异识别算法

• 作者: 宋宜斌 武栓虎 王立宏 秦洋
• 来源期刊: 烟台大学学报(自然科学与工程版)
• 学科: 工学
• 关键词: 潜在语义索引 差异模型 启动子识别
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 211-216
• 分类号: TP301.6
• 字数: 4012字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-8820.2010.03.010

摘要

启动子是基因前面的一个短序列,定位启动子即能找到基因,因此启动子的识别具有重要意义.潜在语义索引差异模型(DLSI)能够扩大类间的差异,降低噪声的干扰,从而提高识别的精度.本文提出基于DLSI的启动子识别算法,利用潜在语义索引差异模型进行特征词选择,通过将样本变换到潜在语义空间中实现降维,建立了启动子 - 外显子、启动子 - 内含子分类器,把两分类器的串联结果作为最终的分类结果.实验验证了算法的有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王立宏	烟台大学计算机科学与技术学院	51	270	8.0	14.0
2	宋宜斌	烟台大学计算机科学与技术学院	31	216	8.0	13.0
3	秦洋	烟台大学计算机科学与技术学院	3	9	3.0	3.0
4	武栓虎	烟台大学计算机科学与技术学院	19	46	3.0	5.0