擎天凤梨GAPDH基因的克隆及序列分析

• 作者: 丁华侨 刘建新 张智 王炜勇 葛亚英
• 来源期刊: 浙江农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 擎天凤梨 GAPDH 克隆
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 722-726
• 分类号: S682.1
• 字数: 2028字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1524.2010.06.003

摘要

管家基因GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)常被用作定量、半定量PCR试验的内参,以确定目标基因的相对表达量.基于前期从全长cDNA文库中获得GAPDH基因的EST单克隆,进行PrimerWalking测序,获得一个GAPDH的全长cDNA序列,序列长1 790 bp,编码421个蛋白氨基酸,命名为GoGAP-DH1.采用Blast,ExPASy,ProtParam,SPOMA,Find Conserved Domains(NCBI),ClustalX,MEGA等生物信息学软件对cDNA序列、氨基酸序列、保守区、亲缘关系等特征进行分析.结果表明,GoGAPDH1与玉米的细胞质GAPDH基因源性最高,为82%.初步推断GoGAPDH1可能是一个胞质型GAPDH.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王炜勇	浙江省农业科学院花卉研究开发中心	47	200	7.0	12.0
2	葛亚英	浙江省农业科学院花卉研究开发中心	32	215	7.0	13.0
3	刘建新	浙江省农业科学院花卉研究开发中心	21	137	6.0	11.0
4	丁华侨	浙江省农业科学院花卉研究开发中心	15	92	5.0	9.0
5	张智	浙江省农业科学院花卉研究开发中心	15	192	6.0	13.0