鸭瘟病毒UL28基因的克隆、鉴定及序列分析

• 作者: 刘菲 娄昆鹏 朱德康 汪铭书 程安春 罗启慧 贾仁勇 陈孝跃
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭瘟病毒 UL28基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 737-745
• 分类号: S8
• 字数: 6932字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.04.018

摘要

对已构建的鸭瘟病毒(DPV)DNA基因文库重组质粒序列测序后,结合ORF Finder和BLAST工具分析得到了DPV UL28基因的开放阅读框.PCR扩增后将其连接至pMD18-T克隆载体,获得完整基因.经测序、PCR和双酶切鉴定,进一步用核酸探针斑点杂交确认完整片段(ORF2412)属于DPV DNA(GenBank登录号EF643557).运用生物信息学分析软件NNPP version 2.2、Translate tool、DNAStar等分析序列特性,并用EMBOSS软件包的CHIPS和CUSP程序分析密码子使用情况.结果显示,其具有疱疹病毒UL28类似家族成员的典型特征,包含1个保守结构域:疱疹病毒加工和组装蛋白(PRTP),并含有多个与功能相关的磷酸化和N-糖基化位点,编码多肽疏水区大于亲水区,是一种膜外蛋白.DPV UL28基因与禽类疱疹病毒(α-疱疹病毒)的亲缘关系最近.UL28基因在密码子选择使用上显示出较强的偏爱性.