利用18S和ITS序列揭示8种鲇形目鱼类的系统发育

• 作者: 俞菊华 卢中华 唐永凯 徐跑 李建林 李红霞 杨光 阮瑞霞
• 来源期刊: 动物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 鲇形目 18S ITS 系统发育
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 110-117
• 分类号: Q951
• 语种: 中文

摘要

为了探讨鲇形目(Siluriformes)鱼类系统发育关系,本研究克隆了黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、长吻(鱼危)(Leiocassis longirostris)、斑鳠(Mystus guttatus)、革胡子鲇(Clarias gariepinus)、鲇鱼(Silurus asotus)和斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)6种鱼类的18S和两个内转录间隔区(包括全长ITS1-5.8S-ITS2)基因,结合GenBank中双须缺鳍鲇(Kryptopterus bicirrhis)和脂鳍胡鲇(Dinotopterus cunningtoni)的同源序列进行比较分析,结果表明,(1)8种鱼18S的长度为1814～1842 bp,同源性达97%以上,5.8S均为157bp,同源性也高达99.36%～100%;(2)8种鱼ITS1长度为335～620bp,其中,黄颡鱼的最长,为618～620bp,斑点叉尾鮰的最短,为335～336bp;ITS2长度为265～459 bp,其中,脂鳍胡鲇最长,为459bp,斑点叉尾鮰的最短,约为270bp.ITS1序列的同源性为29.45%～88.21%,其中,革胡子鲇和脂鳍胡鲇同源性最高,鲇鱼和革胡子鲇同源性最低.ITS2序列的同源性为41.59%～94.07%,其中,革胡子鲇和脂鳍胡鲇间源性最高,鲇鱼和革胡子鲇同源性最低;(3)分别以鲤鱼(Cyprinus carpio)18S和ITS为外群,采用NJ法构建18S、ITS系统发育树,结果显示,鲇科与胡鲇科的关系最近,鲿科与这两科关系较远,鮰科与另外3科关系最远.鲿科中(鱼危)属和黄颡鱼属的关系较鳠属更近;胡鲇科的胡鲇属和脂鳍胡鲇属是关系很近的两个属;鲇科的鲇属和缺鳍鲇属是关系较远的两属.