人ID4基因启动子及上游顺式表达调控元件的克隆及特征分析

• 作者: 党艳辉 刘丽宏 卢学春 张峰 李薇 杨波 迟小华 黄玉
• 来源期刊: 解放军医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: ID4蛋白 人 转录启动子 人工基因融合 计算生物学
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 151-154
• 页数: 4页
• 分类号: R394.114
• 语种: 中文

摘要

目的 克隆人ID4基因启动子及上游顺式调控元件,并对其结构及调控元件的特征进行生物信息学分析.方法 从NCBI人类基因组数据库中截取ID4基因转录起始位点上游5'侧翼区约2242bp及下游5'非翻译区212bp的基因组序列.利用TESS和Crenomax等在线分析软件进行启动子及上游调控元件的特征分析.设计PCR引物,采用分段扩增法,获得长度分别为1811bp和650bp的两条产物片段,分别插入pGEM-T载体,转化至Top10感受态大肠埃希菌,筛选阳性克隆.先后应用KpnⅠ/NheⅠ、KpnⅠ/EcoR Ⅰ对获得的两个pGEM-T重组载体及pGL_3 Basic荧光素酶报告载体进行双酶切,T_4 DNA连接酶连接,转化至Top10感受态大肠埃希菌,筛选阳性克隆,最后测序鉴定.结果 获得长度为2461bp的ID4基因启动子DNA序列,经测序证实与人类基因组序列一致.ID4基因具有Ⅱ型肩动子特征,有2个非常显著的上游元件(TATA盒和GC盒),GC含量占总碱基含量的65.9%.在转录起始位点上游-1000bp与下游212bp之间分别存在多个可能具有正向和负向调控作用的顺式元件.结论 成功克隆了人ID4基因启动子及其顺式调控元件,并证明ID4基因具有典型的Ⅱ型启动子结构.筛选出3个最有可能对ID4表达起凋控作用的顺式元件,分别为糖皮质激素受体、单磷酸腺苷(cAMP)结合蛋白受体及雌激素受体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘丽宏	解放军第二炮兵总医院药剂科	16	97	5.0	9.0
2	李薇	吉林大学第一医院血液肿瘤中心	212	710	11.0	16.0
3	张峰	中国科学院北京基因组研究所	149	3496	30.0	56.0
4	卢学春	解放军总医院南楼血液科	90	756	15.0	21.0
5	杨波	解放军总医院南楼血液科	117	631	13.0	18.0
6	迟小华	解放军第二炮兵总医院药剂科	20	183	7.0	13.0
7	黄玉	吉林大学第一医院血液肿瘤中心	10	51	3.0	7.0
8	党艳辉	吉林大学第一医院血液肿瘤中心	3	18	2.0	3.0