应用16S rRNA基因技术研究仔猪结肠梭菌Ⅳ群变化

• 作者: 朱伟云 苏勇 谢飞 边高瑞
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 16S rRNA 基因 变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE) 仔猪 梭菌Ⅳ群
• 年，卷（期）: 2010,（10）
• 页码范围: 1373-1379
• 分类号: S811.6
• 语种: 中文

摘要

[目的]研究从7日龄到35日龄(断奶后两周)仔猪结肠中梭菌Ⅳ群(柔嫩梭菌群,Clostridium Leptum group)结构以及数量的变化,探究该菌群与结肠中丁酸浓度的关系.[方法]选取3窝新生仔猪,分别在7、14、21(断奶)、24和35日龄每窝随机屠宰1头,收集结肠内容物,利用气相色谱测定挥发性脂肪酸(Volatile fatty acid,VFA);提取结肠内容物总细菌DNA,利用基于16S rRNA基因的变性梯度凝胶电泳(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)和Real-time PCR技术定性、定量分析梭菌Ⅳ群.[结果]对仔猪结肠中梭菌Ⅳ群DGGE图谱进行相似性分析显示,7日龄仔猪样品归于一簇,数值达90%以上,而与其他日龄的样品间相似性较低,断奶前(21日龄)和断奶后3天菌群则没有显著变化.Real-time PCR定量分析显示,仔猪结肠总细菌拷贝数在断奶后3天显著降低,这一趋势与结肠中的总挥发性脂肪酸和丁酸浓度变化相似,而梭菌Ⅳ群拷贝数变化则不显著.克隆和测序分析表明,仔猪结肠梭菌Ⅳ群中的优势菌为Faecalibacterium prausnitzii,Subdoligranulum variabile以及一些未培养细菌.[结论]7日龄至14日龄仔猪结肠中梭菌Ⅳ群发生改变,但断奶对其影响不大;该菌群和结肠丁酸浓度关系还需进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱伟云	南京农业大学消化道微生物研究室	155	2823	28.0	45.0
2	谢飞	南京农业大学消化道微生物研究室	6	36	4.0	6.0
3	苏勇	南京农业大学消化道微生物研究室	21	308	9.0	17.0
4	边高瑞	南京农业大学消化道微生物研究室	6	101	5.0	6.0