中国明对虾核糖体ITS1序列分析及其在对虾科系统分析中的应用

• 作者: 孔晓瑜 张艳春 时伟 李玉龙
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 中国明对虾 对虾科 ITS1 长度多态性 系统发生关系
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 29-36
• 页数: 8页
• 分类号: S917.4
• 字数: 5946字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5174.2010.03.017

摘要

对采自不同群体的5个中国明对虾个体的核糖体RNA转录单元内间隔区1(ITS1)序列特点进行分析,并利用GeneBank数据库中已有的对虾科(Penaeidae)ITS1同源序列对对虾科虾类进行系统分析,探讨ITS1序列在对虾科系统及演化中的应用.结果表明,中国明对虾ITS1序列在个体间和个体内都表现出长度多态性,序列长度范围为637～652 bp,这种长度多态性主要是由于微卫星DNA简单重复序列的重复次数不同所造成.在中国明对虾ITS1序列中发现8个微卫星位点,根据目前已知的12种对虾的ITS1序列,发现某些微卫星位点只存于1种对虾中,如(CAGC)_(2-4)只存在于中国明对虾中,(CGGA)_(4-9)只存在于斑节对虾中,(GCGA)_4只存在于短沟对虾中.利用ITS1序列对12种对虾进行的系统分析表明,12种对虾分为4个类群,同种的不同个体,同属的不同种各自聚支,与形态分类比较吻合.对虾科属间遗传距离范围为0.313～0.977,平均值为0.633,远高于用线粒体基因片段得出的属间的遗传距离,支持将原对虾属的6个亚属提升为属的观点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	时伟	中国海洋大学水产学院教育部海水养殖重点实验室	2	4	2.0	2.0
2	张艳春	中国海洋大学水产学院教育部海水养殖重点实验室	3	22	2.0	3.0
3	孔晓瑜	中国科学院南海海洋研究所	9	50	4.0	7.0
4	李玉龙	中国海洋大学水产学院教育部海水养殖重点实验室	4	11	2.0	3.0