马铃薯卷叶病毒陕西分离物外壳蛋白(CP)的生物信息学分析

• 作者: 吴宽 张珏 谢海峰 颜永杰 高云芳
• 来源期刊: 西北大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 马铃薯卷叶病毒 外壳蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 473-476
• 分类号: S43
• 字数: 2593字
• 语种: 中文

摘要

目的 分析预测马铃薯卷叶病毒(PLRV)外壳蛋白的理化性质及结构.方法 应用DNAMAN软件、ExPASy中的ProtParam工具,SignalP,LipoP程序,TMHMM,PSIPRED和3D-PSSM等方法 ,分析PLRV·CP的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、亲疏水性、可溶性、信号肽、跨膜结构域、二级结构、保守区域、三级结构等.结果 陕西PLRV·CP,与已报道的PLRV·CP高度同源.蛋白序列分析显示无跨膜螺旋结构,不属分泌蛋白,是可溶的亲水性蛋白.二级结构主要为折叠和无规则卷曲,不舍转角.三级结构保守区预测表明,该蛋白属于黄化病毒属外壳蛋白成员.结论 对马铃薯卷叶病毒外壳蛋白的生物信息学分析为进一步研究其功能、探索抗病途径奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高云芳	西北大学生命科学学院	39	558	13.0	22.0
2	张珏	西北农林科技大学生命科学学院	4	46	3.0	4.0
3	颜永杰	西北大学生命科学学院	5	14	3.0	3.0
4	吴宽	西北大学信息科学与技术学院	4	16	3.0	4.0
5	谢海峰	西北大学生命科学学院	2	4	1.0	2.0