小反刍兽疫病毒P基因的克隆及其结构与功能分析

• 作者: 张海瑞 才学鹏 毛立 窦永喜 翟军军 蒙学莲 骆学农
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 小反刍兽疫病毒 P蛋白 克隆 结构与功能 分析
• 年，卷（期）: 2010,（11）
• 页码范围: 2355-2362
• 分类号: S8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.11.020

摘要

[目的]对小反刍兽疫病毒P基因进行克隆,并对其结构和功能的关系进行分析,为研究小反刍兽疫病毒P蛋白的功能及其在病毒增殖过程中的作用奠定基础.[方法]利用RT-PCR的方法对小反刍兽疫P基因全长进行克隆,通过生物学软件对其核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对,利用I-TASSER进行三级结构预测,然后分析其结构和功能之间的关系.[结果]P基因和MV、CDV、RPV、DMV和PDV的P基因的相似性分别为62.9%、63.3%,64.4%、65.1%和60.4%,氨基酸的相似性分别为45.9%、46.2%、50.6%、50.3%和47.0%.三级结构表明该蛋白由3个结构域构成,中间是由多个α-螺旋构成的结构域,主要行使与L大蛋白和RNA结合的功能,两边分别是N-端和C-端结构域,C-端结构域含有3个α-螺旋,分别位于458-468aa,492-499aa和503-505aa位,主要作为N蛋白α-螺旋的结合位点.[结论]本研究成功地克隆小反刍兽疫病毒P基因,分析和预测了p蛋白的结构和功能的关系,为其进一步的生物学功能研究及其应用奠定了基础.