遗传算法和单体型组装加权最小字符翻转问题

• 作者: 姚雄武 文诗华 李晶 郑金华
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 生物信息学 单体型检测 遗传算法 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 所属期刊栏目: 工程与应用
• 页码范围: 217-220
• 页数: 4页
• 分类号: TP18
• 字数: 5827字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2010.08.063

摘要

单体型组装加权最小字符翻转(WMLF)问题指定个体联配的加权DNA片断数据,翻转权值和最小的SNP位点以推测出该个体的一对单体型.该问题是NP-难的,至今尚无实用的搜索寻优算法.根据DNA测序片段数据的特点提出了一种遗传算法.对于实际的生物实验数据,即使数据很大,该算法也可以在较短的时间得到WMLF问题的满意解,具有良好的可扩展性和较高的实用价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑金华	湘潭大学信息工程学院	134	1464	20.0	31.0
2	姚雄武	湘潭大学信息工程学院	2	1	1.0	1.0
3	李晶	湘潭大学信息工程学院	10	77	5.0	8.0
4	文诗华	湘潭大学信息工程学院	10	100	6.0	10.0