海南坡鹿MD2cDNA的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 刘涛 匡文华 张冬琳 张晓茹 成鹰 杜丽 焦寒伟 王凤阳 谢少林 郝永昌 雷明
• 来源期刊: 热带生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 海南坡鹿 MD2 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 1-5
• 分类号: Q786
• 字数: 2513字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7054.2011.01.001

摘要

以海南坡鹿外周血白细胞总RNA为模板,利用RT-PCR技术,获得海南坡鹿MD2全长cDNA,并对其进行较系统的生物信息学分析,内容包括序列特征分析、同源性分析、编码蛋白质理化性质及结构预测.结果表明:海南坡鹿MD2的CDS序列长度为486 bp,编码160个氨基酸,与黄牛、人、欧洲兔、褐家鼠的核苷酸序列同源性分别为98.55%,77.43%,78.47%和74.74%.该基因编码的蛋白质相对分子质量约为19×103,理论等电点为8.18.对编码蛋白的分子结构预测发现,该蛋白为非跨膜蛋白,其二级结构中,α-螺旋占16.25%,β-折叠片占38.13%,无规则卷曲占45.63%.