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中国近海习见头足类DNA条形码及其分子系统进化
中国近海习见头足类DNA条形码及其分子系统进化
作者:
姜志强
庄志猛
林琳
柳淑芳
王鹤
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
头足类
COI基因
DNA条形码
分类鉴定
系统进化
摘要:
应用DNA条形码通用引物扩增了11种中国近海习见头足类(Cephalopoda)共计97个个体的线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(Cytochrome Coxidase I,COI)基因片段,与GenBank收录的19种95条头足类同源序列进行比对.结果表明,头足类COI基因存在碱基插人缺失现象,杜氏枪乌贼(Uroteuthis duvauceli)插人缺失位点数多达33个;碱基组成偏倚明显,A+T含量(66.70%)显著高子G+C(33.30%)含量.基于Kimura双参数模型计算,29个物种的种内平均遗传距离为0.0072,种间平均遗传距离(0.20-2 4)是种内遗传距离的28.11倍.针对剑尖枪乌贼(Loligo edulis,Uroteuthis edulis,Photololigo edulis)分类和命名的分歧,DNA条形码分类结果显示,该物种与枪乌贼属(Loligo)和尾枪乌贼属(Uroteuthis)的COI基因同源性较低,不支持将其划归到Lolig.或Uroteuthis.近爱尔斗蛸属(Pareledone)6个代表物种的种间遗传距离较小(0.0120-0.0385),对于此类变异程度较低的物种,DNA条形码仍可准确区分,但其种间遗传距离的阈值尚待深人探讨.系统发育树的聚类分析结果表明,COI基因在种、属水平的分类鉴定及其系统进化关系与传统方法所得结果一致性较高,分别为100%,91.67%;科、目水平的一致性略低,分别为80%和66.67%.可见,线粒体COI基因作为头足类DNA条形码在物种鉴定中适用性较高,亦适用于种属水平的系统进化分析,是形态学分类系统的必要补充和佐证.
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文献信息
篇名
中国近海习见头足类DNA条形码及其分子系统进化
来源期刊
中国水产科学
学科
生物学
关键词
头足类
COI基因
DNA条形码
分类鉴定
系统进化
年,卷(期)
2011,(2)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
245-255
页数
分类号
Q959
字数
5536字
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1118.2011.00245
五维指标
传播情况
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引文网络
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
中国水产科学
主办单位:
中国水产科学研究院
中国水产学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1005-8737
CN:
11-3446/S
开本:
大16开
出版地:
北京市永定路南青塔村150号
邮发代号:
18-250
创刊时间:
1994
语种:
chi
出版文献量(篇)
3187
总下载数(次)
1
总被引数(次)
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