果蝇基因组中回文序列的分布

• 作者: 刘国庆 包通拉嘎 李宏 蔡禄 邢永强
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 回文序列 重组 自然选择 基因表达调控
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 643-652
• 页数: 10页
• 分类号: Q61
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2011.00643

摘要

回文序列(palindrome)是与基因表达调控、DNA复制和重组密切相关的重要DNA模体.例如,回文序列常存在于基因表达顺式作用元件中,参与基因表达调控;回文序列也可作为限制性内切酶的识别位点或结构信号,诱导重组的发生,而重组作为选择的途径,反过来可能会调节回文序列在染色体上的分布.在全基因组范围内研究回文序列的分布及其与染色体重组的关系,对从分子水平上理解基因表达调控机制及基因组进化有重要意义.本文对果蝇基因组回文序列在染色体上的分布进行了系统的分析,发现果蝇基因组对回文序列的使用是非随机的,回文序列在染色体上的分布受到重组率、基因分布和GC含量等因素的影响.回文序列丰度、回文密度与重组率的关系,以及回文序列GC含量与重组率的关系在常染色体和X染色体上的巨大反差,预示着常染色体和X染色体在功能及进化上的某些根本性差异可能与回文序列有关.