凡纳滨对虾Arf6基因的克隆及表达分析

• 作者: 崔亮 彭金霞 李奎 殷勤 王志伟 陈晓汉
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 凡纳滨对虾 RT-PCR 基因克隆 Arf6
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 60-65
• 分类号: Q785|Q786
• 字数: 3978字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7075.2011.02.010

摘要

通过电子克隆所得序列设计引物,采用PCR扩增方法首次克隆得到长695bp的凡纳滨对虾Arf6基因序列,其中包括96bp的5'非翻译区(Untranslated region,UTR)、71bp的3'非翻译区和528bp的开放阅读框.编码175个氨基酸残基,推算分子量约为20kDa,理论等电点为8.82,分子式为C896H1426N252O255S8.氨基酸序列分析表明,Arf6基因编码的氨基酸序列中具有保守的GTP结合区域,总的带负电荷的残基(Asp+Glu)为21,总的带正电荷的残基(Arg+Lys)为25.与其他物种的Arf6基因进行同源比对发现,该基因的氨基酸序列具有较高的保守性,基于氨基酸序列的聚类分析表明,凡纳滨对虾与果蝇属种类亲缘关系最近.半定量RT-PCR的结果显示,该基因在组织中广泛表达且在肝胰腺中表达量最高,在眼柄中表达最低;其在经桃拉综合征病毒(TSV)感染后的凡纳滨对虾肝胰腺中的表达量显著高于在无特定病原(SPF)凡纳滨对虾;加之ProtFun在线预测蛋白质的功能分类,表明Arf6基因可能是一免疫应答因子参与凡纳滨对虾免疫防御反应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李奎	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	73	382	11.0	16.0
2	王志伟	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	6	63	4.0	6.0
3	陈晓汉		13	118	6.0	10.0
4	彭金霞		5	41	3.0	5.0
5	殷勤	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	3	36	3.0	3.0
6	崔亮		3	36	3.0	3.0