核糖体RNA二级结构对拓扑结构准确性的影响

• 作者: 刘超洋 庄文颖
• 来源期刊: 菌物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 系统发育 序列分析 拓扑结构
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 912-919
• 分类号: Q943
• 语种: 中文

摘要

探讨了核糖体小亚基二级结构对真菌系统发育分析的影响.对用不同方法构建的系统发育树进行比较,结果表明结合二级结构信息的分析方法较传统方法产生了更为合理的拓扑结构.二级结构信息除用于优化序列比对外,还需整合到核酸替代模型中；恰当的序列比对方法、进化模型和建树运算法则有助于更加准确地揭示类群之间的亲缘关系.