陆地棉Dirigent-like基因(GhDIR)的克隆与分析

• 作者: 唐中杰 房卫平 李武 杨晓杰 谢德意 赵付安
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 陆地棉 电子克隆 DIR-like gene 表达分析 大丽轮枝菌
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 页码范围: 29-33
• 分类号: Q78
• 字数: 3753字
• 语种: 中文

摘要

Dirigent-like基因(DIR)编码蛋白质参与木质素的形成,与植物体的病菌防御有关.本研究以抑制差减杂交( SSH)技术获得DIR的EST为信息探针,对棉花EST数据库进行同源搜索和序列拼接,获得了全长为768 bp的DIR基因cDNA全长,将该基因命名为GhDIR.该基因序列的开放阅读框(ORF)位于70 ～594 bp,推测编码175个氨基酸残基的蛋白.用陆地棉基因组DNA和cDNA分别进行了PCR扩增验证,克隆测序结果表明,所得GhDIR序列与电子克隆序列完全一致,没有内含子.序列比对和系统进化分析表明,该基因与海岛棉的同源序列表现了最高的相似性,与其他双子叶植物同源序列的相似性次之,而与单子叶植物同源序列的相似性较远.实时定量PCR表达谱分析表明,该基因在陆地棉幼苗根部受黄萎病菌诱导表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	房卫平	河南省农业科学院经济作物研究所	79	1256	21.0	32.0
2	李武	河南省农业科学院经济作物研究所	23	138	6.0	11.0
3	谢德意	河南省农业科学院经济作物研究所	84	1274	19.0	33.0
4	唐中杰	河南省农业科学院经济作物研究所	31	213	8.0	13.0
5	杨晓杰	河南省农业科学院经济作物研究所	14	37	4.0	5.0
6	赵付安	河南省农业科学院经济作物研究所	3	13	1.0	3.0