rDNA部分序列在食用菌进化关系研究中的应用

• 作者: 吴清平 张菊梅 杨小兵 胡惠萍 黄龙花
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 18S rDNA ITS 食用菌菌种 进化关系 鉴定
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1607-1610
• 页数: 4页
• 分类号: Q751
• 语种: 中文

摘要

目的:建立用rDNA序列分析对食用菌的菌种进行快速分类鉴定的分子技术方法.方法:对香菇、草菇、平菇等十五种常见栽培食用菌的30个菌株的18S rDNA及1TS序列进行测序分析,用NJ(neighbor-joining)法构建系统发育树.结果:由18S rDNA序列构建的系统发育树表明:常见栽培食用菌菌种的门间相似性≥94.2%,纲间相似性≥98.3%,目间相似性≥98.5%,科、属、种间的相似性都极高,在发育树图上亲缘关系近的属种会聚在同一分支.由ITS序列构建的系统发育树表明:常见栽培食用菌菌种的ITS序列在科、属、种水平上的聚类可信度高且易于鉴定区分,侧耳科内香菇属和侧耳属相似性为88%;蛹虫草和冬虫夏草相似性为91%;侧耳属内种间相似性≥99.5%,可信度为99%;香菇种内相似性接近100%,但仍存在细微的碱基差异.结论:本研究首次将18S rDNA和ITS两个目标片段结合分析,对常见栽培食用菌的进化关系进行研究,结果表明rDNA序列分析在食用菌的菌种分类鉴定上是一种快捷有效的方法.