基于混合选择的GEP算法及其在喹诺酮羧酸类HIV-1整合酶抑制剂活性的QSAR研究中的应用

• 作者: 付伟忠 张运陶
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 化学
• 关键词: 改进基因表达式编程 整合酶抑制剂 定量结构活性关系
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 页码范围: 83-87
• 分类号: O641.12
• 字数: 4087字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4160.2011.01.018

摘要

提出1种混合使用模拟退火和竞赛规则选择算子的改进GEP算法-GEPMS 算法.以E-Dragon软件计算、经RM算法筛选得到的7个RDF描述符作为自变量,以抗HIV-1活性IC50值作为因变量,基于 GEPMS 算法建立关于48种喹诺酮羧酸类化合物的HIV-1整合酶抑制剂活性的QSAR模型.与GEP、GEPSA和v-SVM算法建立的QSAR模型进行比较,本文模型、GEP、GEPSA和v-SVM模型对训练集的计算结果,决定系数R2分别为0.9667、0.9624、0.9348和0.9711,对验证集的预测结果R2则分别为0.9565、0.8974、0.9124和0.7656,表明本文的GEPMS模型具有最佳的泛化能力,算法的改进效果明显.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张运陶	西华师范大学应用化学研究所	77	407	10.0	17.0
2	付伟忠	西华师范大学应用化学研究所	5	15	2.0	3.0