蛋白质折叠预测的禁忌搜索粒子群算法

• 作者: 兰任 王宇新 郭禾 陈鑫
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 粒子群算法 禁忌搜索 粒子变异 三维AB非晶格模型
• 年，卷（期）: 2011,（24）
• 所属期刊栏目: 研究、探讨
• 页码范围: 46-50
• 分类号: TP18
• 字数: 4892字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2011.24.014

摘要

针对PSO算法晚期收敛速度慢、求解精度差的缺点,提出了一种改进优化算法——将粒子群算法(Particle Swarm Optimization,PSO)与禁忌搜索算法(Tabu Search,TS)结合起来解决基于三维AB非晶格模型的蛋白质折叠预测问题.TS算法的引入提高了粒子群收敛后期的精度,粒子变异机制增强了粒子跳出局部极小值的能力.真实数据实验表明,该算法计算出的蛋白质序列能量值相比其他算法有更高的精确度,能够更好地模拟蛋白质构象,是分析蛋白质结构的一种有效方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王宇新	大连理工大学计算机科学与技术学院	88	589	12.0	19.0
2	郭禾	大连理工大学软件学院	86	724	14.0	23.0
6	兰任	大连理工大学软件学院	1	4	1.0	1.0
7	陈鑫	大连理工大学软件学院	15	100	7.0	9.0