基于矩阵图谱表达法的蛋白质序列的相似性分析

• 作者: 唐旭清 王寒冰 赵静静 齐斌
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 经典HP模型 混沌游走表达 4线图谱表达 矩阵图谱表达
• 年，卷（期）: 2011,（7）
• 所属期刊栏目: 工程与应用
• 页码范围: 222-225
• 分类号: O29|TP301|Q71
• 字数: 4524字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2011.07.064

摘要

在DNA序列的混沌游走方法(CGR)及DNA序列的4线图谱表达方法(4-LGR)的基础上,提出了一种新型DNA序列的表达方法-矩阵图谱表达法(MGR),并进一步,在DNA序列的上述三种表达式基础上,分别推广建立了基于经典HP模型的蛋白质序列的图谱表达法,对蛋白质序列的相似性进行了比较验证.研究表明:矩阵图谱表达方法不仅能够说明蛋白质序列间的相似性,而且与传统的方法相比,该方法更具有灵活性和变通性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	齐斌	江南大学理学院	14	40	5.0	6.0
3	赵静静	江南大学理学院	8	14	3.0	3.0
6	唐旭清	江南大学理学院	40	707	9.0	26.0
7	王寒冰	江南大学理学院	2	5	2.0	2.0