一种模糊相似关系的基因表达数据聚类方法

• 作者: 姜永森 杨慧中 陆媛
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 模糊相似关系矩阵 聚类中心 模糊C均值聚类(FCM)算法 时序基因表达数据
• 年，卷（期）: 2011,（8）
• 所属期刊栏目: 工程与应用
• 页码范围: 236-238
• 分类号: TP391
• 字数: 3929字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2011.08.068

摘要

对于时间序列的基因表达数据,传统的聚类算法都是以距离为相似性度量标准,没有考虑基因随时间变化的相似趋势.从基因变化的趋势出发,构造了一种新的模糊相似关系矩阵,提出了改进的基于模糊相似关系的聚类算法,并以该算法计算FCM的初始聚类中心.将该方法应用在酵母菌基因表达数据中,实验结果表明该算法不仅克服了FCM算法易陷入局部极小值、对初值敏感的缺点,而且能够发现一些表达模式变化趋势相似的共调控基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨慧中	江南大学物联网工程学院	228	1844	20.0	33.0
2	姜永森	北华大学科研处	5	36	4.0	5.0
3	陆媛	江南大学物联网工程学院	3	17	3.0	3.0