山羊卵巢组织繁殖力相关差异表达基因片段的生物信息学分析

• 作者: 冯安学 贾青 邢增喜 钱丽丽
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 山羊 繁殖力 差异表达基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 693-700
• 分类号: S827|S814.8
• 字数: 4116字
• 语种: 中文

摘要

为考察山羊多羔性的遗传基础,以不同繁殖力的河北中部本地固有山羊为研究对象,在发情期卵巢组织用差异表达PCR方法筛查到4条基因差异片段作为山羊繁殖力性状候选基因.对这些候选基因进行同源性和转录因子结合位点分析,发现4个差异片段中2条为新发现的表达片段.1条与野猪中获得的克隆片段THY010003E05的同源性为81％,但功能未知.另1条差异片段的序列与牛pcnp的mRNA序列的同源性为94％,并据此对山羊pcnp基因进行PCR扩增、克隆及序列测定.应用生物信息学的相关软件和方法,对山羊PCNP蛋白的理化性质、二级结构、信号肽、核定位序列、磷酸化位点、跨膜区域以及蛋白质功能域等进行预测.结果,山羊pcnp基因完整CDS序列与牛的pcnp基因完整CDS序列同源性为100％,编码区为537 bp,编码179个氨基酸；推测与其他已报道的物种一样,山羊PCNP蛋白也是主要位于细胞核中的亲水蛋白,二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主,局部为延伸链和β转角；预测出与PCNP蛋白相互作用的5种蛋白,另外还发现了3个LCR( Low　complexity region)区域.由此推测,PCNP在物种间相对保守,而且其最可能在细胞核中行使功能,对细胞周期或某些基因的表达产生影响,进而影响山羊繁殖力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贾青	河北农业大学动物科技学院	107	516	11.0	18.0
5	冯安学	河北农业大学动物科技学院	4	24	3.0	4.0
6	邢增喜	河北农业大学动物科技学院	7	28	3.0	5.0
7	钱丽丽	河北农业大学动物科技学院	5	19	3.0	4.0