番茄COBRA基因克隆、表达模式及生物信息学分析

• 作者: 刘永胜 唐晓凤 曹颖
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 COBRA基因 克隆 表达模式 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 304-310
• 页数: 7页
• 分类号: S641.2
• 语种: 中文

摘要

COBRA作为一种重要的胞外糖基磷脂酰肌醇(GP-I)锚定蛋白,影响植物细胞壁中纤维素含量及细胞的定向伸长.目前已有多个拟南芥、玉米及水稻的COBRA基因的突变体被研究.而有关番茄COBRA基因克隆的研究尚未见报道.本研究利用RT-PCR技术克隆了一个假定编码番茄COBRA蛋白的S(l)COBRA基因,并在GenBank注册(JN398667).序列测定和分析表明,该序列由6个外显子组成,编码444个氨基酸残基；氨基酸序列中存在COBRA蛋白的CCvS保守基序,N端的跨膜信号肽及C-末端的疏水性尾部和GPI锚定ω-位点.系统进化分析表明番茄SICOBRA与拟南芥AtCOB具有80％氨基酸序列同源性,聚在一个分支上.Real-time PCR分析番茄各个组织中COBRA基因的表达结果表明番茄COBRA为组成型表达,在营养器官(根、茎、叶)中的表达量高于花和果实,尤其在成熟的果实中(从转色期到红熟期)表达量明显减少.