青杄PsbO基因cDNA序列克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘亚静 孙帆 张凌云 李长江
• 来源期刊: 生命科学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 青杄 PsbO基因 RACE 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 201-206
• 分类号: Q781
• 字数: 4163字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7847.2012.03.003

摘要

利用RACE技术从已有的青杄均一化cDNA文库中克隆得到青扦(Picea wilsonii PsbO基因cDNA的全长,并用生物信息学的方法对该cDNA的核苷酸序列、氨基酸序列的相似性,及编码蛋白PwPsbO的理化性质、亲水性/疏水性、二级和三级结构,PwPsbO基因进化树等进行了预测和分析,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术,测定了青杄不同组织中的PsbO基因的相时表达水平.结果发现:青杄PsbO基因编码346个氨基酸,预测相对分子质量为36.6 kD,理论pI值为5.29,属于可溶性蛋白.二级和三级结构预测表明其含有较多的α螺旋、β折叠和随机卷曲结构.RT-qPCR发现该基因在青杄针叶和茎中表达量最高.这些结果为青杄中PsbO基因的初步功能研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李长江	北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室	9	65	4.0	8.0
2	孙帆	北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室	6	41	3.0	6.0
3	张凌云	北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室	39	174	8.0	12.0
4	刘亚静	北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室	6	26	3.0	5.0