丹参SAMDC基因的电子克隆及序列分析

• 作者: 任正隆 卢戟 杜梅泽 邓科君
• 来源期刊: 电子科技大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 电子克隆 多胺 S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶 丹参
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 生物电子学
• 页码范围: 796-800
• 页数: 5页
• 分类号: Q94
• 字数: 3626字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-0548.2012.05.029

摘要

基于丹参EST数据库,以烟草S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因(SAMDC)cDNA序列为信息探针,进行同源搜索,经同源比对和序列组装,分离得到1个新的植物SAMDC基因家族成员,命名为SmSAMDC,全长l 620 bp,经RT-PCR扩增,分子克隆和序列分析验证,结果表明与电子克隆完全一致.该cDNA序列具有完整的开放阅读框架,存在3个植物SAMDC基因特征ORF(tiny ORF、small ORF及main ORF); main ORF编码蛋白质理论分子量为39.4 kD、pI为4.71,均与植物SAMDC酶原蛋白相近.二级结构预测发现,SmSAMDC基因main ORF编码序列中25.28％的氨基酸残基构成a螺旋、24.17％的氨基酸残基构成延伸链、50.56％的氨基酸残基构成随机卷曲.氨基酸序列比对分析结果表明,SmSAMDC与已知植物SAMDC基因家族成员高度同源,具有植物SAMDC基因家族的酶原剪切位点及SAMDC蛋白快速降解相关PEST保守结构域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任正隆	电子科技大学生命科学与技术学院	61	742	15.0	23.0
2	邓科君	电子科技大学生命科学与技术学院	23	255	8.0	15.0
3	杜梅泽	电子科技大学生命科学与技术学院	1	3	1.0	1.0
4	卢戟		3	8	2.0	2.0