STR和SNP对3个小鼠1号染色体替换系筛选结果的比较

• 作者: 刘磊 晁天柱 肖君华 赵丽亚 赵莹 邢正弘 陈国强
• 来源期刊: 实验动物与比较医学
• 学科: 生物学
• 关键词: 1号染色体替换系 STR SNP 分型 比较
• 年，卷（期）: 2012,（5）
• 所属期刊栏目: 华东地区第12届实验动物科学学术交流会优秀论文选刊
• 页码范围: 396-400,420
• 页数: 6页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 4218字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-5817.2012.05.005

摘要

目的 比较STR和SNP对3个1号染色体替换系的分型结果,并为每个替换系选择合适的基因分型方法.方法 采用20个SNP和10个STR位点分别对3个1号染色体替换系N2代各40个样本进行分型.结果 采用20个SNP位点,从C3H/He替换系中筛选到6个样本,从FVB/N替换系中筛选到9个样本,从AKR替换系中筛选到4个样本.采用10个STR位点,从C3H/He替换系中筛选到6个样本,从FVB/N替换系中筛选到10个样本,从AKR替换系中筛选到6个样本.结论 根据每个品系基因组背景不同,可选择三组多重STR方案作为C3H/He替换系的基因分型方法,三组多重SNP方案作为FVB/N和AKR替换系的基因分型方法.