一种新的氨基酸序列进化距离及其应用

• 作者: 杜俊莉 梁丽萍 袁志发 解小莉
• 来源期刊: 浙江大学学报（农业与生命科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 氨基酸序列 进化距离 动力学方程 估计
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 生物科学与技术
• 页码范围: 271-278
• 分类号: Q332
• 字数: 4090字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3785/j.issn.1008-9209.2012.03.006

摘要

在选择的思想下,建立了蛋白质氨基酸序列的进化动力学方程,提出了一个新的蛋白质氨基酸序列的进化距离——选择进化距离,该距离统一了前人提出的各种氨基酸序列的进化距离；将该动力学方程转换为线性模型后,利用最小二乘法可实现模型中参数b的估计；最后,通过17个物种的细胞色素b的氨基酸序列说明了该选择进化距离的计算方法,并根据自展法比较了不同进化距离得到的物种进化树.结果表明,利用选择进化距离构建的进化树与其他几种进化距离得到的进化树的拓扑结构一致,选择进化距离为估计蛋白质氨基酸序列的进化距离提供了新方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	袁志发	西北农林科技大学理学院	74	1183	16.0	32.0
2	解小莉	西北农林科技大学理学院	21	350	7.0	18.0
6	杜俊莉	西北农林科技大学理学院	9	35	4.0	5.0
7	梁丽萍	西北农林科技大学理学院	2	2	1.0	1.0