烟草橙蛋白基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 丁福章 刘小容 卢坤 潘文杰 胡重怡 雷波
• 来源期刊: 烟草科技
• 学科: 生物学
• 关键词: 烟草 橙蛋白基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 烟草农学
• 页码范围: 60-66
• 分类号: Q785
• 字数: 5592字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-0861.2012.04.015

摘要

为了获得烟草OR(NtOR)基因的全长序列和进一步揭示其在特色烟叶形成中的作用,采用同源克隆法从烟草品种K326中克隆了NtOR的全长cDNA和基因组DNA序列,GenBank登录号为JN379458和JN375578.生物信息学分析表明,NtOR基因组DNA全长5027bp,cDNA为1188 bp,编码317个氨基酸残基.NtOR蛋白具有2个跨膜域、1个信号肽剪切位点、5个糖基化位点和11个磷酸激酶修饰位点,二级结构包含12个α-螺旋和20个β-折叠,亚细胞定位于质膜上.系统进化与BLAST分析表明,NtOR是SlOR和ViOR的垂直同源基因.GENEVESTIGATOR数据库的芯片结果显示,NtOR基因在子叶中的表达量最高,其次是成熟叶片、幼茎和花,其他组织器官的表达相对较弱.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘小容	西南大学农学与生物科技学院	4	6	2.0	2.0
2	卢坤	西南大学农学与生物科技学院	10	83	4.0	9.0