基于偶合人工神经网络的近红外光谱对D5S818基因座的分型

• 作者: 汪雪娇 谢洪平 豆兴茹 邱婷 郭莉萍
• 来源期刊: 化学研究与应用
• 学科: 化学
• 关键词: 短串联重复序列 近红外光谱 人工神经网络 基因分型
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1465-1471
• 分类号: O657.3
• 字数: 4323字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1656.2012.10.001

摘要

本文基于近红外光谱结合化学模式识别中的偶合人工神经网络(ANN-ANN)法研究了一种快速、简单和低成本检测STR基因型的方法.选择STR基因座D5S818的差异较小的10-11、11-11、11-12与11-13基因型作为研究对象,将这四个基因型样本进行标准的PCR扩增并采集PCR产物的近红外光谱,以近红外光谱为判别变量,以其中一个ANN( rich-information-extracted ANN,RIE-ANN)用于提取建立判别模型的富信息变量,另一个ANN(discriminant-model-built ANN,DMB-ANN)即用于模型建立.ANN-ANN的网络结构为:338-30-338(RIE-ANN)和30-84(DMB-ANN).对于校正集的校正均方根误差为0.0148,预测集为0.0127,预测准确率达到100％.成功实现了基于近红外光谱对STR基因型的快速、简单和低成本检测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭莉萍	苏州大学医学部药学院	4	5	1.0	2.0
5	汪雪娇	苏州大学医学部药学院	3	4	1.0	2.0
6	豆兴茹	苏州大学医学部药学院	11	18	3.0	4.0
7	邱婷	苏州大学医学部药学院	3	3	1.0	1.0
8	谢洪平	苏州大学医学部药学院	56	223	7.0	12.0