HIV-1包膜单基因Nest-PCR体系优化及包膜基因准种扩增

• 作者: 任彩云 全红 凌虹 刘松 庄敏 张昊天 李妍
• 来源期刊: 哈尔滨医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: HIV-1 包膜 单基因扩增 Nest-PCR
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 323-328
• 分类号: R512.91|R373
• 字数: 3593字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1905.2012.04.003

摘要

目的 确定HIV-1包膜(envelope,env)单基因扩增(single genome amplification,SGA)的最优反应体系,获得env单基因扩增产物.方法 采用SGA及Nest-PCR扩增HIV-1 env全长基因,并对Nest-PCR反应体系中各成分量进行优化；在此基础上,适当稀释HIV-1感染者cDNA模板进行Nest-PCR,以获得PCR扩增产物阳性率不超过30％的模板稀释度.结果 SGA Nest-PCR扩增HIV-1 env全长基因,引物浓度为0.3 μmol/L,dNTP浓度为0.25 μmol/L时可获得特异性高的env全长基因；凝胶回收纯化及稀释第一轮PCR产物可有效提高特异性条带的产量.采用优化反应体系成功从一名HIV-1感染者体内扩增出18株env单基因序列.结论 优化了HIV-1 env基因SGA Nest-PCR的反应体系,并从HIV-1感染者获得了病毒包膜基因准种,为后续进行准种分析奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	凌虹	哈尔滨医科大学微生物学教研室	52	166	7.0	9.0
2	庄敏	哈尔滨医科大学微生物学教研室	33	97	5.0	7.0
3	李妍	哈尔滨医科大学微生物学教研室	22	69	5.0	6.0
4	张昊天		12	13	2.0	3.0
5	全红	哈尔滨医科大学微生物学教研室	1	0	0.0	0.0
6	刘松	哈尔滨医科大学微生物学教研室	1	0	0.0	0.0
7	任彩云	哈尔滨医科大学微生物学教研室	2	2	1.0	1.0