鸡胸腺重和脾脏重性状的全基因组关联

• 作者: 刘丽 刘冉冉 吴丹 孙艳发 张磊 文杰 李鹏 胡耀东 赵桂苹 郑麦青
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 经济
• 关键词: 北京油鸡 胸腺重 脾脏重 全基因组关联分析
• 年，卷（期）: 2012,（15）
• 所属期刊栏目: 兽医
• 页码范围: 3165-3175
• 分类号: F3
• 语种: 中文

摘要

[目的]全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是复杂性状和疾病相关基因定位的新策略.[方法]试验利用鸡60K SNP芯片对来自50个公鸡家系的728只北京油鸡进行SNP分型检测,采用全基因组关联分析方法对影响100日龄胸腺重和脾脏重的基因进行定位研究.[结果]结果发现24个达5％全基因组水平显著的位点,与100日龄胸腺重和脾脏重显著相关,并在这些位点附近发现Janus kinase 1(JAK1)、zinc finger DHHC-type containing 8(ZDHHC8)、vav 3 guanine nucleotide exchange factor(VAV3),SATB homeobox 1(SATB1)等候选基因；84个与这两个性状潜在关联同时达到5％染色体水平显著的位点.[结论]利用GWAS分析策略筛选和鉴定的重要突变位点及候选基因,将为揭示鸡免疫器官发育的分子调控机制和抗病育种分子标记辅助选择提供必要的分子基础.