葡萄基因组密码子使用偏好模式研究

• 作者: 续晨 蔡小宁 贲爱玲 钱保俐
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 分子进化 密码子用法 密码子偏好性
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 409-415
• 分类号: Q786
• 字数: 4663字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4025.2012.02.030

摘要

根据完整基因组序列,运用多元统计分析和对应分析的方法,探讨了葡萄全基因组序列密码子的使用模式和影响密码子使用的各种可能因素.结果显示:葡萄密码子偏好性主要受到碱基差异(r=0.925)和自然选择(r=0.193)共同作用的影响,突变压力占了主导因素,自然选择的作用较小.同时基因长度和蛋白质疏水性也对密码子的偏好性有所影响.确定了葡萄的20个最优密码子.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡小宁	南京晓庄学院生物化工与环境工程学院	33	265	10.0	15.0
2	钱保俐	南京晓庄学院生物化工与环境工程学院	12	59	2.0	7.0
3	贲爱玲	南京晓庄学院生物化工与环境工程学院	45	250	9.0	13.0
4	续晨	南京晓庄学院生物化工与环境工程学院	20	117	5.0	10.0