人溶菌酶基因的密码子优化设计及生物信息学初步分析

• 作者: 任颖 刘博洋 张永宏 杨润军 沈冰蕾 白春艳 闫守庆
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 人溶菌酶基因 密码子优化 猪乳蛋白
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 页码范围: 1392-1395,1399
• 分类号: Q75
• 语种: 中文

摘要

对猪乳蛋白密码子使用偏好性进行了分析,并基于其使用规则,在不改变编码氨基酸序列的基础上对人溶菌酶基因hLYZ的密码子进行了优化设计和生物信息学初步分析。研究结果表明,人hLYZ基因与猪乳蛋白相关基因的密码子使用频率存在明显差异,优化前后猪乳蛋白偏好性hLYZ基因（LYZ-Cas）共改变了109个碱基,约占hLYZ基因碱基总数的24.38%,G＋C含量由47.0%下降至43.8%。改造前后hLYZ基因CDS序列所翻译的氨基酸序列比对结果显示,其氨基酸序列没有发生变化,二级结构预测及Nc值计算显示,其能够在猪乳中相对高效表达。本研究旨在分析并比较优化前后hLYZ基因密码子的生物信息学变化,使其在猪乳蛋白中高效表达,对于生产富含人溶菌酶的hLYZ转基因克隆猪具有重要的理论意义,并且对于提高仔猪成活率,防治哺乳动物乳腺炎,提高乳品质等方面具有巨大的应用潜力。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	闫守庆	吉林大学畜牧兽医学院	32	59	4.0	6.0
2	张永宏	吉林大学畜牧兽医学院	36	179	7.0	11.0
3	刘博洋	吉林大学畜牧兽医学院	5	8	2.0	2.0
4	杨润军	吉林大学畜牧兽医学院	26	52	4.0	5.0
5	白春艳	吉林大学畜牧兽医学院	16	23	3.0	4.0
6	沈冰蕾		1	1	1.0	1.0
7	任颖	吉林大学农学部公共教学中心	2	7	1.0	2.0