斑马鱼G蛋白偶联受体编码基因(DrGPCR)的克隆与表达分析

• 作者: 董超华
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: G蛋白偶联受体 斑马鱼 基因克隆 结构预测 组织表达
• 年，卷（期）: 2012,（20）
• 所属期刊栏目: 水产-应用研究
• 页码范围: 140-147
• 分类号: S9
• 字数: 4481字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6850.2012.20.027

摘要

为了探讨硬骨鱼的G蛋白偶联受体的结构和功能.本研究通过RACE技术结合斑马鱼基因组序列分析,鉴定了一个G蛋白偶联受体的编码基因,命名为DrGPCR.该基因全长2251bp,包括一个1170bp的开放阅读框,编码389个氨基酸的蛋白.用SMART程序对其氨基酸序列进行分析发现,该蛋白包含有7个跨膜结构域,暗示其为膜蛋白.利用BLAST算法搜索非冗余蛋白数据库发现,DrGPCR蛋白与无脊椎动物GPCR家族的FMRFamide受体以及高等脊椎动物的GPCR 139和GPCR142具有高度的氨基酸序列一致性,而且DrGPCR与人GPR139蛋白的三级结构模型具有高度的相似性.序列分析和结构特征都表明DrGPCR是GPCR蛋白家族的一个成员.用邻接法对DrGPCR与绿河豚不同亚族10个GCRP蛋白进行聚类分析发现,DrGPCR属于视紫质受体亚族.通过半定量RT-PCR技术对DrGPCR在斑马鱼各组织的表达进行分析,DrGPCR在脑和肝胰腺中有高水平表达,而在其他被检测的组织没有表达.因此,本研究报道了一个斑马鱼G蛋白偶联受体的编码基因,序列分析和组织表达的结果表明,DrGPCR可能在神经调节和免疫系统中发挥功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董超华	青岛农业大学生命科学学院	6	8	1.0	2.0