一种新的DNA序列3D表示方法及相似分析

• 作者: 綦朝晖 魏若岩
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: DNA序列 3D图形表示 数据降维 相似性分析
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 网络、通信、安全
• 页码范围: 146-148,196
• 分类号: TP391
• 字数: 2411字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2012.04.043

摘要

提出了一种新的DNA序列的3D图形表示方法,该方法能体现较多的DNA序列的特征,而且避免了信息的丢失.为了进行DNA序列之间的相似性分析,在此方法的基础上对图形进行特征提取并利用高维数据降维算法对提取后的高维数据进行降维,并降到3维,降维后的数据不但保持了原有高维数据的特征而且能很方便地观察它们之间的关系.通过对10个物种的β-球蛋白基因的第一个外显子的相似性分析,得到了较好的结果.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	綦朝晖	石家庄铁道大学信息科学与技术学院	14	69	5.0	8.0
2	魏若岩	石家庄铁道大学信息科学与技术学院	1	3	1.0	1.0