植物基因组上游开放阅读框的挖掘方法及其翻译调控

• 作者: 徐建红 王庭璋 胡望雄 薛庆中
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 上游开放阅读框 翻译调控 进化 转录因子 转录物
• 年，卷（期）: 2013,（16）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 3314-3323
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.16.002

摘要

基因组中约有20％的基因具有上游开放阅读框(upstream open reading frame,uORF),它位于成熟mRNA 5′端非编码区(5′-UTR).本文简介了uORF同源群的挖掘方法、分类和进化,以及调控下游mORF翻译的研究进展.植物(拟南芥和水稻等)和昆虫(果蝇等)基因组中普遍存在保守肽uORFs,并且在序列多样性方面有相似之处.但它们在平均长度、基因组聚类、与甲基转移酶的关联性上有所不同.植物uORF的长度通常短于昆虫uORF.借助拟南芥和水稻全长cDNA序列比较,不同的uORF同源群对其下游如转录因子,信号转导因子、发育信号分子和翻译起始因子eIF5等编码基因的mORF具有调控功能.对于真核生物基因组中包含CHCH域的uORF进行贝叶斯系统发育分析,结果表明,同源群8-like分属5个物种(绿藻、节肢动物、线虫、无脊椎动物和真菌).在真核生物生长、发育和生理过程中,uORF通常作为反式因子对mORF表达起调节器作用,例如,在植物蔗糖、多胺、磷脂酰胆碱,以及甲基转移酶反应中,相当大比例的uORF参与介导mORF的翻译调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛庆中	浙江大学农业与生物技术学院	86	2472	28.0	47.0
2	徐建红	浙江大学农业与生物技术学院	21	132	5.0	11.0
3	胡望雄	浙江大学农业与生物技术学院	2	11	2.0	2.0
4	王庭璋	浙江大学农业与生物技术学院	2	3	1.0	1.0