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摘要:
为研究番茄(Lycopersicum esculentum)的SlmiR393基因功能,采用生物信息学方法从番茄基因组数据库中获得SlmiR393的前体序列及其潜在的靶基因.以基因组DNA为模板,克隆了番茄SlmiR393前体基因并整合到pLP35S-100植物表达载体;采用5'RACE RT-PCR技术验证SlmiR393对预测靶基因mRNA的剪切作用,采用定量PCR技术检测SlmiR393及其靶标基因在番茄不同组织的表达.结果表明,SlmiR393的前体序列含有完整的茎环结构;成熟miR393与3个生长素受体同源基因(SlTIR1、SlTIR1-like1和SlAFB)之间具有识别作用位点.SlmiR393可对番茄3个靶基因的转录本进行剪切降解;SlmiR393与3个不同靶基因(SlTIR1、SlTIRl-like和SlAFB)的表达模式在叶和茎、花蕾、花中存在一定的互补关系.因此,推断番茄中的SlmiR393可能在特定的组织或发育时期介导特定的靶基因mRNA的剪切降解,初步证实生长素受体同源基因为SlmiR393的靶基因.此外,成功构建以CaMV35S为启动子的植物表达载体pLP35 S-pre-SlmiR393,为深入研究SlmiR393在番茄生长素信号转导中的功能奠定了基础.
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内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 番茄SlmiR393基因超表达载体的构建及其靶基因鉴定
来源期刊 热带亚热带植物学报 学科
关键词 番茄 SlmiR393 生长素受体同源基因 载体构建
年,卷(期) 2013,(2) 所属期刊栏目 植物生理与分子生物学
研究方向 页码范围 133-140
页数 8页 分类号
字数 5533字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1005-3395.2013.02.006
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 杨迎伍 重庆大学生命科学学院基因工程研究中心 23 277 10.0 16.0
2 李正国 重庆大学生命科学学院基因工程研究中心 49 533 11.0 21.0
3 林冬波 重庆大学生命科学学院基因工程研究中心 3 12 2.0 3.0
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研究主题发展历程
节点文献
番茄
SlmiR393
生长素受体同源基因
载体构建
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
热带亚热带植物学报
双月刊
1005-3395
44-1374/Q
大16开
广州天河区兴科路723号中国科学院华南植物园
1992
chi
出版文献量(篇)
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6
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31320
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