芸芥木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶基因EsXTH1的cDNA克隆和生物信息学分析

• 作者: 令利军 姜海杨 孙万仓 方彦 陈姣荣
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芸芥 自交亲和系 木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶 基因克隆 功能预测
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 131-136
• 页数: 6页
• 分类号: S565.903
• 字数: 3595字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2013.02.004

摘要

为了解XTH(木葡聚糖内糖基转移酶/水解酶)基因在芸芥自交亲和系突变体(self-compatibility,SC)和自交不亲和系(self-incompatibility,SI)育性调控中的作用,分别以芸芥野生型SI系和突变体SC为材料,取植株的全花cDNA为模板,采用mRNA差异显示技术(differential display reverse transcription PCR,DDRT-PCR)筛选差异片段,获得了芸芥XTH基因的全长cDNA(EsXTH1,1 074bp).序列分析表明,EsXTH1的5 ′端和3′端非翻译区分别为36bp和180bp,包含1个858bp的开放阅读框,编码一条285个氨基酸残基组成的肽链；推导的EsXTH1蛋白序列含有XTH蛋白的活性部位DEIDFEFL;芸芥EsXTH1与其它植物的XTH蛋白具有较高的同源性,与拟南芥At-XTH6同源性最高(89.1％),与拟南芥AtXTH7、番茄SlXTH7及康乃馨DcXTH4的同源性分别为73％、73％及69％.分子进化树分析表明,EsXTH1与AtXTH7、SlXTH7、DcXTH4更近.EsXTH1具有木葡聚糖内糖基转移酶(xyloglucan endotran,XET)和水解酶(xyloglucan endohydrolase,XEH)的功能结构位点,N端有一个由23个氨基酸组成的信号肽.预测认为EsXTH1与蛋白质分泌相关,与芸芥自交亲和性的调控相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	令利军	西北师范大学生命科学学院	17	87	6.0	9.0
2	方彦	甘肃农业大学研究测试中心	22	169	8.0	12.0
3	孙万仓		10	94	6.0	9.0
4	陈姣荣		2	9	2.0	2.0
5	姜海杨		2	21	2.0	2.0