杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因(XET)的生物信息学分析

• 作者: 刘笑平 宋双林 李开隆 林永红 王松波 王遂 赵慧
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 杨树 木葡聚糖内糖基转移酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（34）
• 所属期刊栏目: 林业
• 页码范围: 12132-12136
• 页数: 5页
• 分类号: S792.11
• 字数: 3439字
• 语种: 中文

摘要

[目的]通过生物信息学方法对杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因的DNA序列、蛋白质序列进行分析预测,为进一步研究奠定基础.[方法]以XET基因及其氨基酸序列为研究对象,利用多种网络数据库及生物信息学软件对其进行分析预测.[结果]该基因编码290个氨基酸残基,相对分子质量33 672.0 D,理论等电点(pI)7.04;该酶可能存在3个卷曲结构部位、1个信号肽剪切位点和1个跨膜区,是典型的分泌蛋白;三级结构同源建模预测结果较好,二级结构预测中的螺旋、卷曲和折叠均可见.相似性比对和进化分析显示其与葡萄等的序列相似度较高;而蛋白质三级结构的预测则发现,该酶与几种杆菌的蛋白较接近.[结论]XET基因可能在很多生物中具有较高的保守性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李开隆	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	24	201	7.0	14.0
2	赵慧	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	5	18	3.0	4.0
3	王遂	东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室	7	18	3.0	4.0