原核生物大肠杆菌基因组序列形成核小体能力的预测

• 作者: 任松叶 蔡禄 赵秀娟 陈冰
• 来源期刊: 信阳师范学院学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 大肠杆菌基因组 核小体定位 k-mers频数 多样性增量 二次判别
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 基础理论研究
• 页码范围: 204-207,300
• 页数: 5页
• 分类号: Q34
• 字数: 3356字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-0972.2013.02.012

摘要

以大肠杆菌基因组为研究对象,基于体外组装的核小体序列中k-mers频数信息,采用多样性增量结合二次判别算法对核心DNA和连接DNA进行分类预测,整体准确率和相关系数分别达到83.08％和0.619.对大肠杆菌、酵母和人类基因组中核小体定位序列与缺失序列中偏好的k-mers进行了比较,结果表明核小体缺失序列更为保守.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡禄	内蒙古科技大学生物工程与技术研究所	128	509	11.0	16.0
5	赵秀娟	内蒙古科技大学生物工程与技术研究所	51	216	7.0	13.0
9	任松叶	内蒙古科技大学生物工程与技术研究所	3	2	1.0	1.0
10	陈冰	内蒙古科技大学生物工程与技术研究所	1	0	0.0	0.0