酵母基因组中核小体偏好序列的识别

• 作者: 罗辽复 陈伟
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 核小体 多样性增量 二次判别分析
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 页码范围: 159-162
• 页数: 4页
• 分类号: Q523+.8
• 字数: 3399字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2009.02.020

摘要

应用多样性增量结合二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法,对酵母基因组中的核小体强/弱偏好序列进行了识别.10交叉检验的预测成功率超过了97%,受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积达到了0.99,预测成功率高于现有SVM算法.最后利用构建好的分类器对酵母基因组中三类包含TATA盒基因的起始密码子ATG上游400nt下游100nt区域进行了分析.结果表明,IDQD算法有能力应用于基因组中核小体序列的识别.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈伟	内蒙古大学物理科学与技术学院	13	21	3.0	4.0
2	罗辽复	内蒙古大学物理科学与技术学院	101	476	12.0	17.0