酵母核小体中心序列局域偏好和连接序列的多样性

• 作者: 孟虎 李宏 贾芸 郑燕
• 来源期刊: 陕西师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 酵母 核小体 3-mer 相对偏差 保守模体
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 73-79
• 页数: 7页
• 分类号: Q61
• 字数: 5944字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15983/j.cnki.jsnu.2017.03.335

摘要

基于酵母单碱基精度的核小体位置数据,提取核小体中心及连接序列分析两类序列的精细结构和模体偏好.结果显示,区分两类序列最主要的是稀有模体(GCG、CGC、CGG和CCG),其次是富含模体(AAA和TTT).将核小体中心序列等分为3个单元,发现中单元与核小体中心序列相对偏差的分布相似,两翼单元分布部分类似于连接序列,表明中单元的核小体定位信号强而两翼具有连接序列的部分序列特征.通过分析11个核小体连接序列长度组的G+C含量发现其长度与G+C含量成负相关,而MEME模体搜索结果显示11个长度组主要有4类保守模体,意味着连接序列的多样性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李宏	内蒙古大学物理科学与技术学院	160	656	14.0	18.0
2	郑燕	内蒙古大学物理科学与技术学院	2	1	1.0	1.0
3	孟虎	内蒙古大学物理科学与技术学院	2	8	1.0	2.0
4	贾芸	内蒙古大学物理科学与技术学院	1	1	1.0	1.0