广州市2011年肠道病毒71型VP1基因特征分析

• 作者: 和鹏 张颖 狄飚 王鸣 耿进妹 谢华萍 陈纯
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道病毒71型 VP1基因 手足口病 基因型
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 96-101
• 页数: 6页
• 分类号: R373.2+4
• 语种: 中文

摘要

目的 了解广州市2011年肠道病毒71型(EV71)的流行情况及EV71流行株VP1基因特征.方法 用实时荧光PCR方法对手足口病患者标本进行检测,对其中部分EV71阳性粪便标本提取病毒基因组,采用RT-PCR方法扩增VP1区全长基因和序列测定,应用DNA Man和DNA Star软件对序列进行整理分析,用MEGA4.0软件构建系统发生树.结果 1 837份标本中有1 172份肠道病毒阳性,其中EV71阳性357份,占阳性标本的30.46％.7份EV71阳性重症病例与8份EV71阳性普通病例标本EV71 VP1全长为891个核苷酸,编码297个氨基酸.15份标本VP1基因之间的核苷酸同源性为96.7％～99.9％,氨基酸同源性为96.3％～100.0％,重症与普通病例来源的标本之间差异无统计学意义.在系统发生树上,均与C4a亚型代表株处于同一分支,属于C4a亚型,核苷酸同源性为94.1％～95.3％,氨基酸同源性为98.3％～99.0％.结论 广州市2011年流行的EV71病毒为C4a亚型,重症病例和普通病例之间的VP1基因未发现明显的核苷酸变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王鸣		147	1089	16.0	24.0
2	狄飚		70	659	13.0	22.0
3	张颖		23	272	10.0	16.0
4	陈纯		34	408	13.0	19.0
5	谢华萍		23	292	11.0	16.0
6	耿进妹		14	162	8.0	12.0
7	和鹏		10	60	4.0	7.0