线粒体全基因组测序探寻高原环境对Artemia tibetiana和A.urmiana卤虫种线粒体基因的影响

• 作者: 于军 刘飞 吴刚 孙婧 张航晓 王伟伟 罗奇斌
• 来源期刊: 中国科学（生命科学）
• 关键词: 线粒体基因组 Artemia tibetiana 序列变化 高原物种
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 319-331
• 页数: 13页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1007/s11427-013-4474-4

摘要

卤虫(Artemia)属甲壳纲无背甲目,生活于高盐环境中,低海拔和高海拔地区均有分布,在适应不同环境需求的过程中形成了遗传的多样性.为研究卤虫表型的可塑性,本研究对2个来自青藏高原的A tibetiana和1个来自伊朗乌尔米耶湖的Aurmiana的线粒体进行了全基因组测序,将获得的3个序列信息与另一低海拔平原上的卤虫种A.franciscana进行比较分析.在线粒体蛋白编码基因的序列比对中发现:A.franciscana和A.tibetiana/A.urmiana组间atp8基因的Ka/Ks值最高,而A tibetiana和Aurmiana组间,atp6基因的Ka/Ks值最高.鉴于A.tibetiana和Aurmiana遗传距离较近,但分别分布于高海拔和低海拔,环境差异显著,提示在高原环境适应过程中atp6基因可能受到强的选择压力.在D-loop区鉴别到2个延长终止相关的序列(ETASs)和3个保守序列块(CSBs),猜测D-loop或者呼吸链亚基的序列变化,可单独或共作用促进卤虫适应不同海拔环境.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘飞	中国科学院北京基因组研究所	71	509	12.0	19.0
2	吴刚	中国科学院北京基因组研究所	217	3774	29.0	54.0
3	于军	中国科学院北京基因组研究所	40	229	8.0	14.0
4	孙婧	中国科学院北京基因组研究所	5	10	2.0	3.0
5	张航晓	中国科学院北京基因组研究所	1	0	0.0	0.0
6	罗奇斌	中国科学院北京基因组研究所	1	0	0.0	0.0
7	王伟伟	中国科学院北京基因组研究所	9	15	2.0	3.0