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决明查尔酮合成酶的同源模建和分子模拟对接
决明查尔酮合成酶的同源模建和分子模拟对接
作者:
周嘉裕
周虹
廖海
方袁梦梦
李云双
王万军
钟德馨
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
查尔酮合成酶
同源模建
分子对接
决明
类黄酮
摘要:
查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是植物中类黄酮生物合成途径的关键酶,其催化对-香豆酰辅酶A和丙二酸单酰辅酶A发生缩合反应.本研究以苜蓿CHS的晶体为模板,利用同源建模构建决明CHS的三维模型.经过动力学优化后,决明CHS的三维模型与苜蓿CHS的结构极为相似,主要由α-螺旋和β-折叠构成,其中有13个α螺旋,占32.82%,15个β折叠,占19.23%,无规则卷曲占47.95%.模型验证结果表明决明CHS的三维模型具有合理的立体化学性质与氨基酸相容性.决明CHS含有两个重要的结构域:对-香豆酰辅酶A结合域与丙二酸单酰辅酶A结合域.决明CHS与对-香豆酰辅酶A、丙二酸单酰辅酶A的结合主要通过氢键与范德华力.决明CHS中Cys164、His303与活性中心的H2O能够形成电子传递体系,参与对-香豆酰辅酶A形成CHS-对-香豆酰基中间产物.本研究结果为利用此类CHS三维模型研究其催化机理和分子工程改造奠定基础.
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文献信息
篇名
决明查尔酮合成酶的同源模建和分子模拟对接
来源期刊
天然产物研究与开发
学科
生物学
关键词
查尔酮合成酶
同源模建
分子对接
决明
类黄酮
年,卷(期)
2013,(9)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1175-1179
页数
5页
分类号
Q946-3
字数
3522字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王万军
西南交通大学生命科学与工程学院
38
153
7.0
10.0
2
廖海
西南交通大学生命科学与工程学院
56
197
9.0
11.0
3
周嘉裕
西南交通大学生命科学与工程学院
54
196
9.0
11.0
4
方袁梦梦
西南交通大学生命科学与工程学院
2
5
2.0
2.0
5
周虹
西南交通大学生命科学与工程学院
3
8
2.0
2.0
6
李云双
西南交通大学生命科学与工程学院
1
3
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钟德馨
西南交通大学生命科学与工程学院
1
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决明
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研究来源
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研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
天然产物研究与开发
主办单位:
中国科学院成都文献情报中心
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-6880
CN:
51-1335/Q
开本:
大16开
出版地:
四川省成都市一环路南二段16号
邮发代号:
62-107
创刊时间:
1989
语种:
chi
出版文献量(篇)
5862
总下载数(次)
12
总被引数(次)
60408
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