拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因cDNA克隆及其序列特征分析

• 作者: 余斌 刘玉汇 张俊莲 张金文 杨宏羽 王丽 王蒂 白江平
• 来源期刊: 草业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 高亲和性K+载体蛋白 RT-PCR技术 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 230-238
• 页数: 9页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 5909字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11686/cyxb20130629

摘要

以NaCl胁迫处理的拟南芥幼苗叶片为材料,用RNA提取试剂盒抽提总RNA,通过RT-PCR技术和DNA序列测定分析,证实获得了拟南芥高亲和性K+载体蛋白基因(AtHKT1)的cDNA序列.该cDNA全长1521 bp,包括506个氨基酸和1个终止密码子序列,且与原序列(accession number AF237672)同源性为99.34％,但与其他科植物HKT1基因同源性较低,注册该基因到GenBank中,注册号为AY685182.利用生物信息学相关软件分析预测AtHKT1基因蛋白质功能和结构,结果发现,该蛋白分子量为57.45 kD,理论等电点为9.33;氨基酸序列中第1～40个氨基酸属信号肽序列;第152～500个氨基酸属Trk H阳离子转运体蛋白保守结构域,并存在蛋白激酶C,酪氨酸蛋白激酶,依赖cAMP/cGMP蛋白激酶磷酸化,糖基化和豆蔻酰化等功能位点;该基因编码的蛋白有10个跨膜结构,N末端、C末端及中部等多个跨膜区具疏水性,符合载体类运输蛋白特点.表明本研究获得了拟南芥AtHKT1基因.